蛋白质组学研究与临床转化应用中，低丰度蛋白质的定量检测始终是技术瓶颈。这类蛋白虽然表达水平极低，却往往具有极高的生物学意义，例如炎症因子、细胞因子、转录因子或疾病早期标志物。DDA（Data Dependent Acquisition）模式受限于采集深度和动态范围，难以稳定检测这些低丰度靶标。（Parallel Reaction Monitoring）PRM技术凭借其高选择性与灵敏度，为低丰度蛋白的定量分析提供了有效解决方案。本文将深入解析PRM技术在低丰度蛋白检测中的核心优势、实现机制及百泰派克生物科技的技术平台能力。

一、低丰度蛋白质分析的挑战

1、动态范围极广：血浆中蛋白浓度可跨越12个数量级，低丰度蛋白信号极易被高丰度成分掩盖。

2、信噪比低：目标蛋白信号微弱，在复杂基质背景下易被干扰离子淹没。

3、重复性差：其他蛋白组学方法在检测限附近的定量稳定性差，导致跨样本比较误差大。

4、缺乏稳定内标：低丰度靶标缺乏可靠的参考点，易受仪器波动或前处理差异影响。

二、PRM技术如何应对这些挑战？

PRM是在高分辨率质谱平台（如Orbitrap）上运行的靶向质谱技术，其特点在于：对特定母离子进行选择性碎裂，随后对其所有碎片离子进行全扫描采集，从而在多个维度上提升低丰度蛋白质的检测能力。

核心优势如下：

1、高分辨率消除背景干扰

（1）PRM技术常用的Orbitrap质谱仪可提供>30,000的分辨率，有效区分质荷比相近的干扰离子。

（2）精确质量筛选窗口（±5 ppm）大幅提高信噪比，增强低丰度信号的识别能力。

2、多碎片离子增强定量特异性

（1）相比SRM只能采集1~2个transition，PRM可同时记录全部碎片离子，后期选择最优组合用于定量。

（2）多维确认机制显著提升低丰度信号的可信度。

3、自由选择定量离子，提高重现性

研究者可根据每次运行数据，自由选择最佳离子对进行定量，缓解信号不稳问题。

4、结合稳定同位素内标实现精准校准

合成的SIL肽段在质谱行为与靶标肽段完全一致，可有效补偿进样波动与离子化效率差异。

三、影响PRM技术检测低丰度蛋白效果的关键因素

1、肽段选择质量

（1）优选具有良好离子响应、无修饰、无二义性的特征肽段。

（2）可结合DIA数据、数据库预测工具辅助筛选（如PeptideAtlas、Prosit）。

2、样本预处理与富集技术

采用蛋白脱盐、SPE固相萃取、免疫富集（如SISCAPA）等方法去除高丰度背景，提升目标信号占比。

3、色谱分离性能优化

（1）提高保留时间稳定性，防止目标信号在复杂洗脱过程中被掩盖。

（2）可使用多维色谱或延长梯度增强分离度。

4、质谱采集参数调节

调整孤立窗口大小、注入时间（IT）与自动增益控制（AGC）设置，确保低丰度离子充分采集。

四、百泰派克生物科技的PRM技术平台

百泰派克生物科技在低丰度蛋白质靶向定量领域积累了丰富的技术经验，构建了以下优势体系：

1、设备平台先进：采用Orbitrap Exploris 480等高分辨仪器，提供高灵敏度、高通量的PRM分析能力。

2、方法学定制开发：根据客户靶标特性，个性化设计肽段、优化参数、定制SIL内标。

3、全流程标准化质控：从样本处理、肽段合成、数据分析到项目报告，均设有严格质量控制节点。

4、复杂样本适配能力：针对血浆、脑脊液、细胞裂解液等高背景样本，提供富集和前处理解决方案。

PRM技术凭借其高选择性、高灵敏度和高度定量一致性，正逐步成为低丰度蛋白质分析的主流手段。面对疾病标志物验证、药物靶点研究等场景，PRM为科研人员提供了强有力的数据支持。百泰派克生物科技将持续优化PRM平台能力，为客户提供更精准、更可靠的低丰度蛋白定量服务。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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